Благодетелями Кельи Святителя Спиридона в разные времена были переданы мощи почитаемых святых угодников и иные святыни православного мира.
Наиболее известные среди них: частица Животворящего Креста Господня; мощи любимого святого русского народа – Николая Чудотворца; мощи покровителя общины – Спиридона Тримифунтского;
покровителей Италийской земли – первоверховных апостолов Петра и Павла; святых великомучеников Георгия Победоносца и Димитрия Солунского;
частица раки блаженной Матроны Московской и иных.
У мощей, находящихся в Келье совершается полный круг суточного богослужения. А в интервалах между службами ежедневно читается Псалтирь по древнему чину обители Неусыпающих.
Записки за здравие и об упокоении, подаваемые на сорокоуст поминаются каждый день у мощей святых на утрене и малом повечерии. Также и имена, подаваемые на Псалтирь, поминаются у святынь кельи на каждой кафизме.